De nieuwe Veilig leren lezen biedt ruimte voor verschillen. De methode biedt de leerkracht de mogelijkheid in te spelen op de verschillende leerbehoeften binnen een groep door middel van een steraanpak, raketactiviteiten en zonmaterialen. Kinderen met een normale leesontwikkeling volgen de basislijn, de zogenoemde maanlijn. Het computerprogramma bij Veilig leren lezen is voorzien van een vergelijkbare indeling.

Het computerprogramma is net als de methode opgebouwd uit 12 kernen. Elke kern bestaat uit een oefenblok en een toetsblok. In kern 1 zit bovendien een ‘blok 0’ waarin het startniveau van een kind wordt getoetst. Het resultaat hiervan bepaalt of het kind in kern 1 de ster-, maan-, of raketlijn gaat volgen. (Zonkinderen volgen de raketlijn van het computerprogramma.)
In het oefenblok krijgt het kind oefeningen op zijn eigen niveau. Het toetsblok aan het einde van de kern bevat controletaken die inzicht geven over de beheersing van de oefenstof. Naar aanleiding daarvan bepaalt het programma welke lijn het kind in de volgende kern gaat volgen.

Wanneer een kind met het computerprogramma start, geeft het in het instapscherm aan welke letter het als laatste heeft geleerd. Per kern leren de kinderen meerdere letters. Het programma volgt de methode en biedt instapmomenten die samenhangen met de geleerde letters. Het instapmoment dat het kind in het scherm kiest, is, in combinatie met de lijn die het volgt, bepalend voor de inhoud van het programma. Vanaf kern 7, als alle letters zijn aangeboden, zijn de instapmomenten anders ingedeeld. Het kind heeft dan de keuze uit twee instapmomenten per vaardigheid (technisch lezen, spellen en begrijpend lezen).